Gyakute-Do Aiki-Jujutsu wywodzi się z systemu Daito-ryu, który był pierwszą szkołą powszechnie propagującą styl Aiki-Jutsu. Szkoła Gyakute-Do została założona przez Tadashi Tanaka Chushudo -Soushi (pierwszego głównego mistrza stylu). Duży wpływ na rozwój tej szkoły miał również styl Hakko-ryu, pod wpływem którego Tanaka-Soushi założył nową szkołę, koncentrując się na technikach nadgarstkowych. Wówczas nosiła ona nazwę Goshin Bugei GyakuteDo i skupiała się na technikach dźwigni i rzutów z wykorzystaniem siły i sprytu wykonujących techniki.
Przez pewien czas po śmierci Tanaka-Soushi w 1993 roku, szkoła Gyakute-Do nie miała osoby, która mogłaby stanąć na czele organizacji. Okazało się, że spadkobierca szkoły od kilku lat mieszka w Holandii, nauczając sztuki Gyakute-Do. W 2013 roku następnym Soushi (najwyższym mistrzem szkoły) został mistrz Makoto Kurabe.
Kenjutsu w Budojo jest oparte na szkole Kashima Shin Ryu, która zrodziła się podczas okresu burzliwych wojen w średniowiecznej Japonii i zachowała ciągłość i wierność przekazu przez blisko już 500 lat.